2003年5月，某市煙草公司向某銀行申請貸款2000萬元，并用一塊以出讓方式取得的土地（已取得土地使用權證）進行抵押。于是銀行與該公司簽訂了貸款合同，并且辦理了抵押土地的登記手續(xù)。在取得貸款后的一年多時間里，煙草公司在用于抵押的土地上建起了簡易倉庫，出租給鄰近的金屬公司臨時存放貨物，但沒有辦理租賃合同登記備案手續(xù)。后煙草公司無法按期償還貸款，于是銀行要求拍賣其抵押的土地，以抵償貸款。煙草公司在此時卻提出，土地的所有權屬于國家，煙草公司無權將其抵押，認為抵押合同無效。銀行堅持不同意，并提出不僅要將土地進行拍賣，而且要求煙草公司將土地抵押期間所得的租金收益也應交給銀行。雙方爭執(zhí)不下，于是銀行向法院起訴。
問題：
（1）煙草公司能否將以出讓方式取得的土地進行抵押？為什么？
（2）煙草公司與金屬公司簽訂的租賃合同是否有效？為什么？
（3）銀行能否對該土地抵押期間的租金收益主張權利？為什么？
（4）本案應如何處理？